随着卫生事业体制改革的深化，群众对医疗卫生服务质量提出了更高要求。上海市嘉定区卫生局系统上下及时调整思路，提出了以管理促效益的内部管理理念，将内部审计作为强化内部控制的重要手段。内审工作逐步从单一的监督型转向监督与服务并举、从事后审计向事前介入、事中监督前移，从揭示问题向分析体制、制度和管理上的原因、提出对策转变，内审参与管理的意识更加超前、方法更加完善、作用更加明显，内审职能在优化中逐步实现转型。

首先，完善内审组织建设，整合内审人力资源。该局系统是有着54个基层单位、4200多名工作人员、10亿多元年度业务收入的组织。面对家大、业大的现状，该局领导高度重视内部管理，设立了内审工作领导小组，局长任组长，局成立了审计室，由一名专职内审员、四名兼职内审员组成。至2009年年底，该局所属的28家医疗卫生单位均开展了内审工作，其中15家设置内审机构，3家为专职机构。该局系统共有内审员42名，其中5名为专职内审员。所属单位内审员既从事本单位内审工作，又以特约内审员身份参与该局统一安排的系统内内审工作。该局通过局本部和基层单位两级内审网络，缓解了内审工作人少事多的矛盾，实现了内审工作的全覆盖。

其次，强化内审制度执行，建立内审长效机制。该局根据内审工作制度，明确了责任分工。局长作为内审领导小组组长，肩负着年度内审项目计划的研究审批、内审制度及重大事项的协调审议、审计报告等业务文书的审核签发等责任。审计室作为内审工作牵头部门，除组织审计外，还负有提高内审员审计理论水平和实务操作能力，及督导执行内审工作制度的任务。一方面，请有关老师，给该局系统内审员、财务员讲解内部审计准则与内部审计操作实务，开展内审员业务交流，参加区审计局组织的内审培训、讲座，及内审资格证书考试。另一方面，审计室牵头制定了经济责任审计联席会议制度、审计人员审计职业道德规范、审计项目立卷归档制度等内部规章，所属单位结合本单位工作，配套制定内审办法，明确责任分工，实行责任追究，各项内审制度得到了切实贯彻，形成了内审工作长效监督机制。

第三，联手专项审计调查，抓住要害提出建议。该局针对医疗卫生专项资金类多、量大、分散的特点，由审计室牵头，每年对部分专项资金使用管理实施审计调查。通过编制统一的审计调查实施方案，确定调查内容与重点，局和所属单位两级内审网络联动审计调查，形成各单位专项审计调查结果报告和卫生局系统综合审计调查结果报告。2009年第二、第三季度，通过对区中心医院、区疾病预防控制中心等六家区级医疗卫生单位2008年度部分专项资金审计调查，重点分析这些专项资金立项申报的必要性、合理性和规范性，及使用管理的经济性、效率性和效果性，调查发现部分专项资金立项缺少依据、申报手续不全、预算不够细化和使用缺乏合理等问题。为此，提出应建立专项资金立项鉴证制度、加强项目中期督查制度和完善项目结项绩效评估制度等建议。

第四，开展预算管理审计，全程监督执行预算。该局发现前些年因预算申报与预算执行之间信息不对称导致预算“松弛“现象，便着手开展预算管理审计。将部门预算执行审计重心，由事后向事前介入、事中督查转移，事前重点审计申报的项目，是否符合区政府的医疗卫生工作五年规划，是否纳入该局的年度工作计划，是否经过可行性分析和专家论证;事中重点审计项目建设实施的质量、数量、进度，突出预算执行的合规性;事后重点审计项目投入使用后，能否满足业务需求，有无闲置浪费、利用率低下，是否产生预期效益。通过预算管理审计，基本消除了预算执行偏差，减少了预算执行中的无效成本和失误，确保了预算执行的合规性、有效性。

第五，积极配合国家审计，实现审计工作双赢。近年来，区审计局安排对卫生局系统的审计项目较多，尤其是开展审计调查和绩效审计。该局领导将一直国家审计作为提高本部门管理水平的契机。要求内审员、财务员和其他业务员积极配合，提供相关资料，解答相关问题。同时，坦诚与审计局人员交换沟通对审计发现问题的看法，分析原因，共同制定整改办法，由于审计双方对问题、建议和意见建立在协商共识的基础上，因此大部分问题在审计期间就能得到整改。对农村居民基本医疗保险基金和社区卫生服务资金使用管理两个专项调查项目，及对区中心医院项目迁建前后绩效审计项目，受到了区政府及有关部门的高度重视，区领导作出批示，卫生局等部门制定出台了相关政策，实现了国家审计与内部审计的双赢。